AA_sims/1_1_HEP_TOL/qsub_xj.sh
AA_sims/1_1_HEP_TOL/run_gmx.sh
AA_sims/1_1_HEP_TOL/state.cpt
AA_sims/1_1_HEP_TOL/state_old.cpt
AA_sims/1_1_HEP_TOL/state_prev.cpt
AA_sims/1_1_HEP_TOL/toluene.itp
AA_sims/1_4_HEP_TOL/
AA_sims/1_4_HEP_TOL/1_4_HEP_TOL.gro
AA_sims/1_4_HEP_TOL/1_4_HEP_TOL.mdp
AA_sims/1_4_HEP_TOL/1_4_HEP_TOL.top
AA_sims/1_4_HEP_TOL/1_4_HEP_TOL.tpr
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/#md.log.1#
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/#nb_potential.xvg.1#
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/#rerun.edr.1#
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/1_1_NPT2_inter_2body_rerun.o4184656
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/1_1_NPT2_inter_2body_rerun.o4340355
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/1_1_NPT2_inter_2body_rerun.o4340409
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/1_4_HEP_TOL.top
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/2body.tpr
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/heptane.2body.itp
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/md.log
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/mdout.mdp
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/nb_potential.xvg
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/notrr.mdp
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/qsub_rerun.sh
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/rerun.edr
AA_sims/1_4_HEP_TOL/2body_rerun/toluene.2body.itp
AA_sims/1_4_HEP_TOL/U_W.xvg
AA_sims/1_4_HEP_TOL/aa_kineticE.xvg
AA_sims/1_4_HEP_TOL/aa_pressures.xvg
AA_sims/1_4_HEP_TOL/aa_volumes.xvg
AA_sims/1_4_HEP_TOL/full_traj.edr